Архитекторами проекта стали лауреат Государственной премии, архитектор Марк Васильевич Демидовцев, а также Вячеслав Николаевич Ижиков, по проектам которого построены десятки храмов России. Здание выполнено в традициях древнерусского зодчества. Примеры подобной архитектуры в неорусском стиле в большей степени представлены в столице – это здания Исторического музея, ГУМа, храма Василия Блаженного.
На данный момент при Академии действуют два храма. Верхний храм освящен в честь трех великих вселенских учителей и святителей Василия Великого, Григория Богослова, Иоанна Златоустого. Здесь проходят почти все богослужения, а также Литургии с участием студентов Академии и Гуманитарного колледжа. Нижний храм освящен в честь святителя Николая, архиепископа Мир Ликийских. Оба храма были освящены в сентябре 2014 года митрополитом Самарским и Тольяттинским (ныне – Самарским и Новокуйбышевским) Сергием в сослужении городского духовенства.
Главная особенность верхнего храма – иконостас. Он невысокий: такими они создавались в древнерусских храмах, а до того – в византийских. Иконостас выполнен иконописной мастерской под управлением Андрея Фехнера (г. Москва). Иконы написаны артелью под руководством Татьяны Санниковой. Несколько икон в иконостас и киоты были написаны тольяттинским мастером Виктором Берхом. Иконы написаны в традиционном русском ключе. Многие из них покрыты басмой, серебряным давленым покрытием. Это тоже древнерусская техника. В убранстве икон и священных предметов использованы сусальное золото, натуральные краски, камни и самоцветы. Храмовые иконы отличаются своеобразием, многие из них были написаны специально для нашего храма. В них описана история всей христианской святости.
Покровители храма были выбраны неслучайно. Василий Великий, Григорий Богослов, Иоанн Златоуст – образованнейшие мужи своего времени, великие подвижники, проповедники, богословы и педагоги, внесшие огромный вклад в формирование христианского богословия и христианского богослужения, сохранившие чистоту православного христианства. Это прекрасные образцы для учащихся. Наш храм становится неотъемлемой частью жизни института, его духовным сердцем.
Рядом с храмом возвышается здание колокольни, высота которой составляет 57 метров. На её вершине установлена звонница, состоящая из 16 колоколов. Четыре самых больших колокола имеют собственные имена: Алексий (благовест, вес более двух тонн), Святитель (в честь св. Николая Чудотворца), Князь (в честь русских благоверных князей), Ярославль (колокол отлит в Ярославле и посвящен памяти протоиерея Бориса Старка, духовника нашего настоятеля протоиерея Димитрия). На колокольне в будущем планируется проводить концерты и даже фестивали колокольного звона.